Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms