Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms