Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms