Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms