Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms