Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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RPL39P5Q59GN2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL39P5Q59GN2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL39P5Q59GN2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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RPL39P5Q59GN2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL39P5Q59GN2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL39P5Q59GN2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL39P5Q59GN2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL39P5Q59GN2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL39P5Q59GN2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL39P5Q59GN2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL39P5Q59GN2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL39P5Q59GN2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPL39P5Q59GN2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPL39P5Q59GN2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPL39P5Q59GN2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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