Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms