Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms