Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms