Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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