Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP6Q16828 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP6Q16828 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms