Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMA3Q16787 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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