Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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