Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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