Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms