Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLFQ16534 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLFQ16534 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLFQ16534 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HLFQ16534 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HLFQ16534 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms