Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms