Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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