Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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CDSNQ15517 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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CDSNQ15517 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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