Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRKQ15262 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRKQ15262 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms