Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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