Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms