Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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RAB3GAP1Q15042 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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RAB3GAP1Q15042 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
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RAB3GAP1Q15042 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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RAB3GAP1Q15042 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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