Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms