Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms