Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLINT1Q14677 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms