Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.8 ms