Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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DDX39BQ13838 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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