Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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