Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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