Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms