Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRQ13535 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRQ13535 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRQ13535 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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