Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RLFQ13129 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RLFQ13129 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RLFQ13129 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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