Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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TRAF1Q13077 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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TRAF1Q13077 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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TRAF1Q13077 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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TRAF1Q13077 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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TRAF1Q13077 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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TRAF1Q13077 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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TRAF1Q13077 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
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TRAF1Q13077 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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TRAF1Q13077 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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