Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms