Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms