Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FMODQ06828 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FMODQ06828 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FMODQ06828 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FMODQ06828 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FMODQ06828 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FMODQ06828 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FMODQ06828 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FMODQ06828 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms