Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms