Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNG1Q06432 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms