Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms