Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms