Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DSG1Q02413 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms