Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms