Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms