Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms