Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VLDLRP98155 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms