Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms