Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP9P55211 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CASP9P55211 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP9P55211 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms