Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms