Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RORCP51449 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RORCP51449 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RORCP51449 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RORCP51449 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RORCP51449 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RORCP51449 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RORCP51449 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RORCP51449 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RORCP51449 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RORCP51449 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RORCP51449 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RORCP51449 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RORCP51449 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RORCP51449 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RORCP51449 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms